Atualmente duas Unidades Básicas de Saúde seguem com vacinação contra a COVID 19 de segunda à sexta, das 8h às 11h e das 13h às 16h. São elas: UBS Machados e UBS São Domingos I. Para pessoas com idade a partir dos 12 anos, a Unidade Machados aplica segunda dose da AstraZeneca e Pfizer e primeira dose de reforço. Para quem tem acima de 30 anos, também a segunda dose de reforço.
Já na Unidade São Domingos I, a vacinação segue para adolescentes e adultos ainda não vacinados com a primeira dose, segunda dose da AstraZeneca, Coronavac e Pfizer, dose adicional para quem recebeu a Janssen, primeira dose de reforço (acima de 12 anos) e segunda dose de reforço (a partir de 30 anos). Nesta unidade também acontece a vacinação de crianças a partir de três anos.
A campanha da vacinação da Poliomielite teve início no dia 8 de agosto e foi prorrogada até o fim de setembro com o intuito de aumentar as coberturas vacinais e a adesão da população. As doses permanecem disponíveis mesmo com o fim da campanha vacinal. A Secretaria Municipal de Saúde de Navegantes, desde a primeira semana de vacinação traçou estratégias para alcançar as coberturas desejáveis (busca ativa, vacinação em escolas, ações aos sábados e horários estendidos) de acordo com a estimativa populacional estabelecida pelo Ministério da Saúde de 5.707 crianças com faixa etária de um a quatro anos de idade. Ao final da Campanha o município de Navegantes, teve um total de 3.497 doses aplicadas, alcançando 61,27% da cobertura vacinal.
As doses contra poliomielite estão disponíveis nas Unidades Básicas de Saúde (UBS) com sala de vacina, de acordo com o Programa Nacional de Imunizações (PNI) para crianças com 15 meses (1º reforço) e aos 4 anos (2º reforço). E ainda, as UBS Central, Meia Praia, Verde Mar, São Pedro, São Paulo, São Domingos II, Nossa Senhora das Graças, Porto das Balsas e Machados fornecem todas as vacinas do calendário básico, sendo elas: BCG, Hepatite B, Poliomielite, pneumocócica 10 valente, Rotavírus, Penta Valente, Tríplice Viral, Tríplice Bacteriana, Hepatite A, HPV, Febre Amarela, Meningo ACWY, Meningocócica C, Varicela e Influenza.